Юрий Михайлович Гусаков родился в Москве. Воспитанник школы ЦСКА. В качестве футболиста выступал за дубль армейцев, костромской «Спартак», тюменский «Геолог», немецкий клуб «Формация», камышинский «Текстильщик». В 1991 и 1992 годах играл за «Зенит» на позиции нападающего.
За всю свою карьеру забил 85 мячей. В 1994 году занял с «Текстильщиком» 6-е место в чемпионате страны, что позволило клубу из районного центра впервые в своей истории выйти в еврокубки и дойти до стадии 1/16 финала Кубка УЕФА.
После окончания игровой карьеры закончил экономический факультет Института государственного администрирования. С 1997 по 2001 работал в «Зените» администратором, в 2002-2003 — начальником команды. В 2004 году перешел в донецкий «Металлург» на должность заместителя технического директора, в 2005-м вернулся в Санкт-Петербург и через год снова приступил к администрированию основного состава.