Артема впервые привели на просмотр в футбольную школу «Смена» в семь лет. Впрочем, тренеры не сразу разглядели потенциал молодого игрока и отправили его повышать мастерство в секцию при зенитовской школе. Удача улыбнулась юному футболисту через год — наставник Альберт Александрович Дзугуров сразу же взял его в первую группу.
Начинал Водянников на позиции крайнего полузащитника. Только в старших возрастных категориях тренеры перевели Артема на край обороны, где он и выступает по сей день.
В составе коллектива Академии 1997 года рождения Водянников не раз становился победителем первенства города, но золотой дубль покорился ему лишь в 2014 году, когда команда выиграла Кубок Санкт-Петербурга, а Артем забил один из мячей в финальном матче.
Примером для подражания на футбольном поле Водянников считает защитника мюнхенской «Баварии» и сборной Австрии Давида Алабу.
